中草藥所含化學成分很復雜，通常有糖類、氨基酸、蛋白質、油脂、蠟、酶、色素、維生素、有機酸、鞣質、無機鹽、揮發油、生物堿、甙類等。每一種中草藥都可能含有多種成分。在這些成分中，有一部分具有明顯生物活性并起醫療作用的，常稱為有效成分，如生物堿、甙類、揮發油、氨基酸等。如黃連中抗菌消炎的小檗堿（黃連素）、麻黃中平喘的mahuangjian、蘿芙木中的降壓成分利血平等

目前認為中藥的有效成分主要包括蒽醌、生物堿、黃酮、香豆素、木脂素、萜類、皂苷等類化合物。在研究中草藥的工作中，必須了解中草藥化學成分的組成、性質、分布、以及對中草藥成分的鑒定、含量測定、提取分離、結構鑒定等有關知識。其中分離制備就成關鍵的一步。

一般來說，常用的方法是利用溫度不同引起溶解度的改變進行分離，常用結晶與重結晶。結晶的原理：溫度不同，溶解度不同。溶劑的選擇：“相似相溶”原則。

常用的重結晶溶劑，極性從大到小排列：水、冰醋酸、甲醇、乙醇、丙酮、yimi、三氯甲烷、苯、silvhuatan、石油醚和二硫化碳。

結晶純度的判斷：

①形態和色澤：一定的晶形和色澤均勻；

②熔點和熔距：單一化合物一般有一定熔點和較小熔距（1～2℃之間）；

③色譜分析：不同的系統條件，均為單一斑點；

④高效液相色譜法（HPLC）優點：樣品用量小、操作時間快、靈敏度高和準確，已成為中藥化學的常規分析方法；

氣相色譜法（GC）也適用于中藥常規分析。

⑤其他方法：質譜和核磁共振。

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